化国外先进科学技术与李刚抄录的技术、原理为主，下设轻武器研究所、火炮研究所、化工研究所、电气研究所、钢铁研究所、轮船研究所、浮空研究所、辎重装备研究所，各研究所与各工厂相配合。
船政学堂，开设船舶制造、船舶维修、船舶轮机、船舶驾驶、船舶航海、军舰炮术、陆海测绘等专业，教师从台州的永宁学堂分了一部分，再从国外招募了一部分，学员从向全国招募。
译书馆，主要任务，翻译西方科学书籍，从事西学教育以及福建各学堂的西学教师的培训。
工厂守备队，下设立陆地守备团、海上戒备大队（从何伯处购买的三艘炮艇、5艘巡逻艇组成）
一期工厂结束后，马尾机器各个部门就齐全，虽然有些部门还只是挂个牌子，里面只有一两个人办公，比如电气研究所就一个稍懂电气的人在负责，但是随着发展，会越來越完善的。
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福州城到马尾不需要太长的时间，众人骑马并不需要多少的时间。
遥遥看见马尾机器制造局的新建大门口挂着大红绸，门正中上挂李汝绍苍劲有力的題字：“马尾机器制造局”大字（李刚的字太对不起观众，这个殊容就让给受过良好国学熏陶的李汝绍了）。
门前的操场上站满了制造局的人，制造局总办华衡芳（本來李刚为不想把历史改变太多，想请沈葆贞出山，但是沈嫌李刚出身土匪不愿帮李刚，李刚对这个林则徐的女婿也无可奈何，只好让担任研究所所长的华衡芳兼任总办，让原烟厂总办张文渊过來任副办，负责常务与生产）正笑容满面的拱身欢迎前來恭贺的客人。
华衡芳看见李刚等人过來快步上前拱身说道：“大人，你等可來了，快來压阵。”华衡芳对研究在行，对于这些迎接的客套礼节就有点难为他了，看到李刚等人下马过來他马上要撂挑子了。
李刚对这个只知道干事不大精通交际的知识分子沒大沒小的话语也不计较他一跃下马说道：“华先生，恭喜恭喜，以后福建的格致西学就仰仗华先生了。”
“那里、那里，在下还得感谢李大人，我看大人是大清洋务第一人啊！”华衡芳由衷地说道。他有李、曾等洋务干将有过交往，众人搞洋务早于李刚，但投入与成效最大的还是李刚处，不仅仅军工与民生，大大好于其他洋务派。
“华先生客气了，要
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