拜太祖为青州牧、镇东将军。
六年春正月，太祖将兵三千，破徐和于平原，收降众十万。
三月，太祖军济南、乐安、齐、北海，数战数捷，收降众百万，青州遂定。
四月，襄帝崩，少帝即位。
九月，董卓废少帝，改立陈留王协为帝。
初平元年春正月，桥瑁诈作三公移书，山东州郡起兵讨卓，癸酉，董卓杀弘农王。
太祖军孟津。
时袁绍惮太祖，暗与董卓通。
九月，太祖一战而破董卓、袁绍、王匡，阵斩董卓都督华雄，董卓败退洛阳。
太祖复与战，再破，董卓败退长安。
初平二年，太祖合孙坚、曹操，将兵十万，再讨董卓，数败之，董卓震怖，以皇甫嵩拒郑县。
太祖拔郑县，军长安，卓畏太祖之威，悬帝于宫门之上。
太祖惮之，时袁绍与诸侯暗谋袭取青州，太祖闻之，遂退。
太祖以为青州被围，绍必于沿途设伏，遂率轻骑绕道幽州，乘船南下，袭绍之后，时河面无风，船只难以行进，太祖拔剑骂天，立时狂风大作，暴雨倾盆。
绍军遇雨，不知太祖来到，城破之时，尚在梦中。
太祖破南皮，复与绍战于平原，破之，青州之围遂解。
孙坚杀兖州刺史刘岱。
初平三年夏四月，诛董卓，夷三族。
五月，太祖军冀州，十日，韩馥降。
六月，兖州刺史孙坚战没，太祖援兖州，破袁术。
九月，太祖将兵十万，西征勤王，破张济、斩李傕，降郭汜、樊稠、马腾等。
汉帝以太祖勤王有功，拜大将军。
初平四年，太祖征汉中张鲁，破之，益州刘焉将兵十万来犯，太祖大破之，擒焉、鲁。
帝拜太祖为丞相。
兴平元年，太祖迁天子于邺，破公孙瓒于易。
二年，破公孙度于襄平。
建安元年，太祖定五年计划，休养生息。
五年，贵人董氏反，夷三族，太祖将兵四十万，征荆州、汝南等地。
袁术自戕，刘表、曹操投降，天下遂定。
六年，太祖命张郃征交州，皇后伏氏反，夷三族。
帝以太祖功高，封燕公，建燕国，立宗庙，官员百僚如汉初诸侯王制。
八年，太祖以鲜卑轲比能不服王化，将兵百四十万伐之。
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